le_flagelle_bacterien_est_irreductiblement_complexe

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 ===== Le flagelle bactérien est irréductiblement complexe ===== ===== Le flagelle bactérien est irréductiblement complexe =====
 <note important>//Le flagelle bactérien et les cils des eucaryotes sont irréductiblement complexes. Comme aucun système intermédiaire non fonctionnel n’aurait été préservé par la sélection naturelle, ces systèmes peuvent seulement être expliqués par l’Intelligent Design//((Behe, Michael J. 1996. Darwin's Black Box, New York: The Free Press, pp. 59-73. ))</note> <note important>//Le flagelle bactérien et les cils des eucaryotes sont irréductiblement complexes. Comme aucun système intermédiaire non fonctionnel n’aurait été préservé par la sélection naturelle, ces systèmes peuvent seulement être expliqués par l’Intelligent Design//((Behe, Michael J. 1996. Darwin's Black Box, New York: The Free Press, pp. 59-73. ))</note>
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   *Un pore passif non spécifique se transforme en pore passif plus spécifique par addition de protéine(s) pont (ou porine) Le transport passif se transforme en transport actif en ajoutant une ATPase qui associe l'hydrolyse de l'ATP à une capacité d'exportation améliorée. Ce complexe constitue un système d'exportation primitif de type III.   *Un pore passif non spécifique se transforme en pore passif plus spécifique par addition de protéine(s) pont (ou porine) Le transport passif se transforme en transport actif en ajoutant une ATPase qui associe l'hydrolyse de l'ATP à une capacité d'exportation améliorée. Ce complexe constitue un système d'exportation primitif de type III.
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   *Le système d'exportation de type III est converti en un système de sécrétion de type III (T3SS) par addition de protéines des pores de la membrane externe (sécrétine et chaperone) provenant du système de sécrétion de type II. Ceux-ci finissent par former les disques P et L, des flagelles modernes. Le système de sécrétion moderne de type III forme une structure remarquablement similaire à la structure en bâtonnets et en anneaux du flagelle ((Hueck, C. J. 1998. Type III protein secretion systems in bacterial pathogens of animals and plants. Microbiology and Molecular Biology Reviews 62: 379-433. )) ((Blocker, Ariel, Kaoru Komoriya, and Shin-Ichi Aizawa. 2003. Type III secretion systems and bacterial flagella: Insights into their function from structural similarities. Proceedings of the National Academy of Science USA 100(6): 3027-3030. http://www.pnas.org/cgi/content/full/100/6/3027 )).   *Le système d'exportation de type III est converti en un système de sécrétion de type III (T3SS) par addition de protéines des pores de la membrane externe (sécrétine et chaperone) provenant du système de sécrétion de type II. Ceux-ci finissent par former les disques P et L, des flagelles modernes. Le système de sécrétion moderne de type III forme une structure remarquablement similaire à la structure en bâtonnets et en anneaux du flagelle ((Hueck, C. J. 1998. Type III protein secretion systems in bacterial pathogens of animals and plants. Microbiology and Molecular Biology Reviews 62: 379-433. )) ((Blocker, Ariel, Kaoru Komoriya, and Shin-Ichi Aizawa. 2003. Type III secretion systems and bacterial flagella: Insights into their function from structural similarities. Proceedings of the National Academy of Science USA 100(6): 3027-3030. http://www.pnas.org/cgi/content/full/100/6/3027 )).
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   *Le T3SS sécrète plusieurs protéines, dont l'une est une adhésine (une protéine qui colle la cellule à d'autres cellules ou à un substrat). La polymérisation de cette adhésine forme un [[wpfr>pilus]] primitif, une extension qui donne à la cellule une capacité adhésive améliorée. Après l’évolution du pilus T3SS, le pilus se diversifie pour diverses tâches plus spécialisées par la duplication et la sous-fonctionnalisation des protéines du pilus (pilines).   *Le T3SS sécrète plusieurs protéines, dont l'une est une adhésine (une protéine qui colle la cellule à d'autres cellules ou à un substrat). La polymérisation de cette adhésine forme un [[wpfr>pilus]] primitif, une extension qui donne à la cellule une capacité adhésive améliorée. Après l’évolution du pilus T3SS, le pilus se diversifie pour diverses tâches plus spécialisées par la duplication et la sous-fonctionnalisation des protéines du pilus (pilines).
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   *Un complexe de pompe à ions ayant une autre fonction dans la cellule devient fortuitement associé à la base de la structure du système de sécrétion, convertissant le pilus en un protoflagellum primitif. La fonction initiale du protoflagellum est une meilleure dispersion. Les homologues des protéines motrices MotA et MotB sont connus pour fonctionner chez divers procaryotes indépendamment du flagelle.   *Un complexe de pompe à ions ayant une autre fonction dans la cellule devient fortuitement associé à la base de la structure du système de sécrétion, convertissant le pilus en un protoflagellum primitif. La fonction initiale du protoflagellum est une meilleure dispersion. Les homologues des protéines motrices MotA et MotB sont connus pour fonctionner chez divers procaryotes indépendamment du flagelle.
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   *La liaison d'une protéine de transduction du signal à la base du système de sécrétion régule la vitesse de rotation en fonction de la santé métabolique de la cellule. Cela impose une dérive vers les régions favorables et éloignée des régions pauvres en éléments nutritifs, telles que celles trouvées dans les habitats surpeuplés. C'est le début de la mobilité chimiotactique.   *La liaison d'une protéine de transduction du signal à la base du système de sécrétion régule la vitesse de rotation en fonction de la santé métabolique de la cellule. Cela impose une dérive vers les régions favorables et éloignée des régions pauvres en éléments nutritifs, telles que celles trouvées dans les habitats surpeuplés. C'est le début de la mobilité chimiotactique.
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   *De nombreuses améliorations suivent l'origine du flagellum fonctionnant grossièrement. Notamment, de nombreuses protéines axiales différentes (tige, crochet, lieurs, filaments, coiffes) proviennent de la duplication et de la sous-fonctionnalisation des pilines ou de la structure axiale flagellaire primitive. Ces protéines finissent par former la famille de protéines axiales.   *De nombreuses améliorations suivent l'origine du flagellum fonctionnant grossièrement. Notamment, de nombreuses protéines axiales différentes (tige, crochet, lieurs, filaments, coiffes) proviennent de la duplication et de la sous-fonctionnalisation des pilines ou de la structure axiale flagellaire primitive. Ces protéines finissent par former la famille de protéines axiales.
  
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 3. Les flagelles eubactériens, les flagelles archéobactériens et les cils utilisent des motifs totalement différents pour la même fonction. Il fallait s'y attendre s'ils évoluaient séparément, mais cela n'aurait aucun sens s'ils étaient l'œuvre du même designer. 3. Les flagelles eubactériens, les flagelles archéobactériens et les cils utilisent des motifs totalement différents pour la même fonction. Il fallait s'y attendre s'ils évoluaient séparément, mais cela n'aurait aucun sens s'ils étaient l'œuvre du même designer.
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 +4. Les tenants de l'ID ont également affirmé que le flagelle bactérien était composé de nombreuses protéines non homologues, invalidant l'explication évolutionniste. Largement exagérée à l'époque (les anti-évolutionnistes parlaient de 30 protéines, quand 2 n'avaient pas d'homologie connue(([[http://www.talkorigins.org/indexcc/CB/CB200_1_1.html|Claim CB200.1.1 The flagellum has 30 or so unique (non-homologous) proteins.]] -  Index to Creationnist Claims, par Mark Isaak)) ), cette affirmation s'est, sans surprise, révélée fausse, quand des homologies ont été trouvés chez toutes les protéines de flagelle dans une comparaison de 41 espèces différentes(([[https://www.pnas.org/content/104/17/7116|Stepwise formation of the bacterial flagellar system]], Renyi Liu and Howard Ochman, PNAS April 24, 2007 104 (17) 7116-7121; https://doi.org/10.1073/pnas.0700266104)).
  
 ==== Pages connexes ==== ==== Pages connexes ====
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 ==== Voir aussi ==== ==== Voir aussi ====
   * [[http://www.talkorigins.org/indexcc/CB/CB200_1.html|CB200.1: Bacterial flagella and Irreducibly Complexity]] -  Index to Creationnist Claims, par Mark Isaak   * [[http://www.talkorigins.org/indexcc/CB/CB200_1.html|CB200.1: Bacterial flagella and Irreducibly Complexity]] -  Index to Creationnist Claims, par Mark Isaak
-  *Matzke, N. J. 2003. Evolution in (brownian) space: a model for the origin of the bacterial flagellum. http://www.talkdesign.org/faqs/flagellum.html or http://www.talkreason.org/articles/flag.pdf (see also 'Background to "Evolution in (Brownian) space"', http://www.talkdesign.org/faqs/flagellum_background.html or http://www.talkreason.org/articles/flagback.cfm)  +  * [[http://www.talkorigins.org/indexcc/CB/CB200_1_1.html|Claim CB200.1.1 The flagellum has 30 or so unique (non-homologous) proteins.]] -  Index to Creationnist Claims, par Mark Isaak 
-  *Dunkelberg, Pete. 2003. Irreducible complexity demystified http://www.talkdesign.org/faqs/icdmyst/ICDmyst.html  +  *Matzke, N. J. 2003. [[http://www.talkdesign.org/faqs/flagellum.html|Evolution in (brownian) space: a model for the origin of the bacterial flagellum.]] ou http://www.talkreason.org/articles/flag.pdf (voir aussi [[http://www.talkdesign.org/faqs/flagellum_background.html|'Background to "Evolution in (Brownian) space"']]ou http://www.talkreason.org/articles/flagback.cfm)  
-  * Musgrave, Ian. 2000. Evolution of the bacterial flagella. http://www.health.adelaide.edu.au/Pharm/Musgrave/essays/flagella.htm +  *[[http://www.talkdesign.org/faqs/icdmyst/ICDmyst.html|Irreducible complexity demystified]], Dunkelberg, Pete. 2003. - Traduction ici : [[l_ic_demystifiee|L'IC démystifiée]] 
 +  * Musgrave, Ian. 2000. [[https://web.archive.org/web/20121108081740/https://health.adelaide.edu.au/Pharm/Musgrave/essays/flagella.htm|Evolution of the bacterial flagella]].
   *Ussery, David. 1999. A biochemist's response to "The biochemical challenge to evolution". Bios 70: 40-45. http://www.cbs.dtu.dk/staff/dave/Behe.html - Traduction ici : [[Réponse d'un biochimiste au défi biochimique à l'évolution]]   *Ussery, David. 1999. A biochemist's response to "The biochemical challenge to evolution". Bios 70: 40-45. http://www.cbs.dtu.dk/staff/dave/Behe.html - Traduction ici : [[Réponse d'un biochimiste au défi biochimique à l'évolution]]
 +  *[[https://doi.org/10.1038/nrmicro1493|From The Origin of Species to the origin of bacterial flagella]], Pallen, M., Matzke, N - Nat Rev Microbiol 4, 784–790 (2006). 
 +  *[[https://phys.org/news/2020-04-evolution-bacterial-movement-revealed.html|Evolution of bacterial movement revealed]] - Leiden University - phys.org, 2020
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 ==== Erreur de l’argument ==== ==== Erreur de l’argument ====
   * Occultation des faits   * Occultation des faits
-  * [[L'argument d'incrédulité]]+  * [[L'argument d'incrédulité|Argument d'incrédulité]]
  
 ==== Références ==== ==== Références ====
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